Ниско въглехидратната диета на Аткинс повишава нивата на холестерола. Това е така, защото храните, които се приемат са с по-високо съдържание на мазнини. Диетата помага в кратки срокове за редуциране на теглото, но не влияе добре в дългосрочен план на организма.
Резултатите от 25-годишно проучване показват, че популярната диета на Аткинс може да повиши риска от сърдечно-съдови заболявания. Според ръководителят на изследването професор Йохансон от Университета на Умеа, Швеция диетата на Аткинс не гарантира дългосрочно отслабване, а и значително завишава риска от сърдечно-съдови заболявания.